22. 慈恩殿
慈恩殿被認為建於西元17世紀初期。此建築以中國僧侶窺基（西元632年至682年）命名，他在日本被尊稱為慈恩大師，並與其師父玄奘（西元602年至664年，日本稱玄奘三藏）共同創立了法相宗。現今，藥師寺為日本法相宗的總本山。
西元2019年，前首相細川護熙（西元1938年生）以藝術家的身分，在慈恩殿內完成了名為《東與西的融合》的壁畫。這件作品由66個面構成，環繞著寬敞的正殿。壁畫的靈感來自絲綢之路，以及玄奘三藏遠赴印度求取佛經的艱辛旅程。他帶回中國的佛經，奠定了法相宗的基礎，後由弟子慈恩大師加以弘揚。在左後方牆面上，繪有慈恩大師的畫像，畫中他回首望向師父玄奘的雕像；該雕像供奉於慈恩殿後方的寶塔之中，而寶塔內則安置著玄奘的頭骨碎片。
慈恩殿原為位於大阪的長久寺之本堂。西元1962年，因長久寺寺院規模大幅縮減，慈恩殿被遷移至藥師寺。其後於西元1984年再度遷移，成為藥師寺新建的玄奘三藏院伽藍的一部分。遷建工程於西元1988年完成，並重新命名為慈恩殿。
依據建築風格與工法，專家推斷慈恩殿最初建於西元十七世紀初期。慈恩殿傳統的入母屋造，中國稱為「歇山頂」，以銅板覆蓋的屋頂，顯示著這座建築的崇高地位。根據長久寺的紀錄，此殿為淀殿（西元1567年至1615年）所資助興建。淀殿是戰國名將豐臣秀吉（西元1537年至1598年）的側室，即妾侍。相傳，她委託建造此殿，是為了祈求其子豐臣秀賴（西元1593年至1615年）武運昌隆，建造時並使用了興建大阪城所剩餘的建材。雖然原大阪城已於西元1615年遭到毀壞，但其歷史片段至今仍保存在慈恩殿之中。
慈恩殿每年於4月下旬至5月上旬，以及10月下旬至11月上旬開放參觀，並展出壁畫《東與西的融合》。
