Le temple Yakushi-ji, riche d’une histoire de 1 300 ans, a été fondé en 680 par l’empereur Tenmu pour prier pour la guérison de son épouse (qui deviendra plus tard l’impératrice Jito), alors malade.
Cependant, à l’exception de la pagode de l’Est, tous les bâtiments ont été ravagés par les nombreuses catastrophes, naturelles ou causées par l’homme, survenues tout au long de la longue histoire du temple. Par conséquent, il ne reste rien du magnifique complexe d’origine du temple (garan), qui fut construite dans le style architectural du « Palais du Dragon » (ryugu-zukuri).

Pour le temple Yakushi-ji, la reconstruction de l’enceinte monastique disparue (garan) était un vœu cher de longue date. En 1968, le prêtre en chef du temple de l’époque, Takada Koin, déclara que « nous pouvons prospérer matériellement mais périr spirituellement » et entreprit de reconstruire le complexe monastique porteur de spiritualité, précisément parce que le Japon traversait une période de croissance économique rapide. Dans ce but, il commença à collecter des fonds pour reconstruire le Hakuho Garan (le complexe monastique de l’époque de Hakuho) en sollicitant des dons par le biais de l’O-shakyo.
Son objectif était de reconstruire le pavillon principal en sollicitant des dons par le biais d’un million de rouleaux d’O-shakyo. Takada Koin parcourut le Japon à pied et appela le peuple à « redécouvrir son âme admirable » par la pratique de l’O-shakyo. Son objectif de réaliser un million de rouleaux a été atteint en 1976. Cette même année, le pavillon principal célébra son achèvement.